2.8. nf-core
Com altres iniciatives que ja hem tractat anteriorment, Nextflow també té un repositori de workflows per poder ser executats. Aquest conjunt de pipelines s’agrupa en el projecte nf-core (https://nf-co.re/). Per poder treballar directament des de el terminal s’ha generat el paquet nf-core tools per poder gestionar els diferents workflows accessibles en nf-core. nf-core tools està escrit a Python i es pot instal·lar des de la següent adreça: https://nf-co.re/tools.
Per poder veure els diferents paquets simplement es pot fer un llistat:
$ nf-core list
Moltes vegades necessitem ser més específics en la nostra recerca i, per això, podem filtrar:
$ nf-core list rna
O fins i tot ordenar per estrelles:
nf-core list rna --sort stars
Cada repositori té la seva pròpia pàgina amb instruccions i documentació. La utilització d’aquests repositoris públics permet un aprenentatge més ràpid de les eines de Nextflow en el context específic de la bioinformàtica. Igualment, nf-core també proporciona un canal directe de preguntes mitjançant un compte a Slack (https://nf-co.re/join).