{"id":164,"date":"2023-10-10T11:54:38","date_gmt":"2023-10-10T09:54:38","guid":{"rendered":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/workflows\/?page_id=164"},"modified":"2023-10-10T11:54:38","modified_gmt":"2023-10-10T09:54:38","slug":"2-1-introduccio","status":"publish","type":"page","link":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/workflows\/2-1-introduccio\/","title":{"rendered":"2.1. Introducci\u00f3"},"content":{"rendered":"<p>Com a exemple de Workflow Manager en aquesta secci\u00f3 utilitzarem un dels programes m\u00e9s estesos amb una comunitat creixent i amb m\u00e9s suport, com \u00e9s Nextflow.<\/p>\n<p>En primer lloc, hem d\u2019instal\u00b7lar Nextflow seguint les instruccions directament de la seva p\u00e0gina web (<a href=\"https:\/\/www.nextflow.io\/\" target=\"_blank\" rel=\"noopener\">https:\/\/www.nextflow.io\/<\/a>).<\/p>\n<p>Nextflow combina tres elements: un entorn d\u2019execuci\u00f3, un programa espec\u00edfic per llan\u00e7ar altres programes i un DSL espec\u00edfic. L\u2019estrat\u00e8gia que implementa Nextflow en la creaci\u00f3 de <em>pipelines<\/em> \u00e9s la de crear m\u00f2duls per a cada pas en el <em>pipeline<\/em> i vehicular-los i interconnectar-los a trav\u00e9s de canals. Una de les caracter\u00edstiques m\u00e9s importants de Nextflow \u00e9s la reutilitzaci\u00f3 d\u2019aquests m\u00f2duls per a diferents estadis d\u2019un mateix <em>pipeline<\/em> o entre diferents <em>pipelines<\/em>. L\u2019execuci\u00f3 dels diferents m\u00f2duls no \u00e9s lineal, sin\u00f3 que dep\u00e8n de la disponibilitat dels <em>inputs<\/em> per executar-se. Si dos m\u00f2duls independents requereixen els mateixos <em>inputs<\/em> o <em>inputs<\/em> independents es poden executar simult\u00e0niament per despr\u00e9s poder convergir en un altre posteriorment si es requereix.<\/p>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"<p>Com a exemple de Workflow Manager en aquesta secci\u00f3 utilitzarem un dels programes m\u00e9s estesos amb una comunitat creixent i amb m\u00e9s suport, com \u00e9s Nextflow. En primer lloc, hem d\u2019instal\u00b7lar Nextflow seguint les instruccions directament de la seva p\u00e0gina web (https:\/\/www.nextflow.io\/). Nextflow combina tres elements: un entorn d\u2019execuci\u00f3, un programa espec\u00edfic per llan\u00e7ar altres [&hellip;]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/workflows\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/164"}],"collection":[{"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/workflows\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/workflows\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/workflows\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/workflows\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=164"}],"version-history":[{"count":2,"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/workflows\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/164\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":166,"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/workflows\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/164\/revisions\/166"}],"wp:attachment":[{"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/workflows\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=164"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}