{"id":791,"date":"2023-10-19T12:13:56","date_gmt":"2023-10-19T10:13:56","guid":{"rendered":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/introduccion-a-los-entornos-de-trabajo-gnu-linux\/?page_id=791"},"modified":"2025-02-11T00:49:31","modified_gmt":"2025-02-10T22:49:31","slug":"1-17-4-descarga-de-las-herramientas-de-ucsc","status":"publish","type":"page","link":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/introduccion-a-los-entornos-de-trabajo-gnu-linux\/1-17-4-descarga-de-las-herramientas-de-ucsc\/","title":{"rendered":"1.17.4. Desc\u00e0rrega de les eines d’UCSC"},"content":{"rendered":"

El navegador gen\u00f2mic d\u2019UCSC ofereix de manera gratu\u00efta les seq\u00fc\u00e8ncies dels genomes de m\u00faltiples esp\u00e8cies i les pistes d\u2019anotacions associades a cada versi\u00f3. A m\u00e9s, aquest portal web tamb\u00e9 proporciona acc\u00e9s lliure a un conjunt d\u2019eines dissenyades espec\u00edficament per analitzar les dades gen\u00f2miques. Aquests programes funcionen en l\u00ednia d\u2019ordres i es distribueixen llestos per funcionar en diverses plataformes de la fam\u00edlia UNIX. Per mostrar el funcionament de l\u2019ordre rsync<\/code> en la desc\u00e0rrega d\u2019un directori web complet, haureu d\u2019obtenir una c\u00f2pia completa de les utilitats d\u2019UCSC. A la taula 20 es detallen els accessos a les adreces de desc\u00e0rrega.<\/p>\n

Taula 20. Acc\u00e9s a les adreces de desc\u00e0rrega d\u2019utilitats d\u2019UCSC.<\/p>\n<\/div>\n\n\n\n\n\n
Acc\u00e9s<\/td>\nDirecci\u00f3<\/td>\n<\/tr>\n
P\u00e0gina informaci\u00f3<\/td>\nhttps:\/\/hgdownload.soe.ucsc.edu\/downloads.html#utilities_downloads<\/a><\/td>\n<\/tr>\n
P\u00e0gina descarrega utilities<\/em><\/td>\nhttps:\/\/hgdownload.soe.ucsc.edu\/admin\/exe\/linux.x86_64\/<\/a><\/td>\n<\/tr>\n<\/tbody>\n<\/table>\n

Font: elaboraci\u00f3 pr\u00f2pia.<\/p>\n<\/div>\n

Per a aix\u00f2 s\u2019accedeix novament a la p\u00e0gina de desc\u00e0rregues del navegador. Un cop all\u00e0, busca la secci\u00f3 Utility Tools and Software downloads<\/em> (en catal\u00e0, Eines d\u2019utilitat i desc\u00e0rregues de <\/em>software). En aquesta secci\u00f3 expliquen com descarregar-lo.<\/p>\n

Per descarregar totes les utilitats de l\u00ednia d\u2019ordres en un directori amb els bits<\/em> de permisos correctes, utilitza l\u2019ordre seg\u00fcent:<\/p>\n

$ pwd<\/pre>\n
\/home\/student<\/pre>\n
 $ mkdir UCSC-utilities<\/pre>\n
\u00a0$\u00a0cd\u00a0UCSC-utilities<\/pre>\n
$ rsync -aP hgdownload.soe.ucsc.edu::genome\/admin\/exe\/linux.x86_64\/ .\/<\/pre>\n
Despr\u00e9s de m\u00e9s de 5 minuts s\u2019haur\u00e0 descarregat el 5 % de les utilitats. Aquest proc\u00e9s \u00e9s lent i ens adonem que ha d\u2019ocupar molt espai, m\u00e9s espai del que hi ha lliure en el disc dur del nostre ordinador. Mata el proc\u00e9s prement les tecles Ctrl + X i es parar\u00e0 la desc\u00e0rrega. \u00c9s una prova per veure que funciona l\u2019ordre rsync<\/code>. Esborra tot el que has generat.<\/p>\n
$ cd ..<\/pre>\n
$ pwd<\/pre>\n
\/home\/student<\/pre>\n
$ rm -r UCSC-utilities<\/pre>\n
Una altra opci\u00f3 \u00e9s descarregar \u00fanicament les utilitats que es vulguin utilitzar, per exemple, es descarrega la utilitat liftOver<\/em>.<\/p>\n
$\u00a0pwd<\/pre>\n
\/home\/student<\/pre>\n
$ wget https:\/\/hgdownload.cse.ucsc.edu\/admin\/exe\/linux.x86_64\/liftOver<\/pre>\n
 $ chmod +x \/home\/student\/liftover\/liftOver<\/pre>\n
# Executa el programa sense arguments per veure un missatge d\u2019\u00fas<\/pre>\n
$ cd liftOver<\/pre>\n
$ . \/liftOver<\/pre>\n","protected":false},"excerpt":{"rendered":"
El navegador gen\u00f2mic d\u2019UCSC ofereix de manera gratu\u00efta les seq\u00fc\u00e8ncies dels genomes de m\u00faltiples esp\u00e8cies i les pistes d\u2019anotacions associades a cada versi\u00f3. A m\u00e9s, aquest portal web tamb\u00e9 proporciona acc\u00e9s lliure a un conjunt d\u2019eines dissenyades espec\u00edficament per analitzar les dades gen\u00f2miques. Aquests programes funcionen en l\u00ednia d\u2019ordres i es distribueixen llestos per funcionar […]<\/p>\n","protected":false},"author":1,"featured_media":0,"parent":0,"menu_order":0,"comment_status":"closed","ping_status":"closed","template":"","meta":[],"acf":[],"_links":{"self":[{"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/introduccion-a-los-entornos-de-trabajo-gnu-linux\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/791"}],"collection":[{"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/introduccion-a-los-entornos-de-trabajo-gnu-linux\/wp-json\/wp\/v2\/pages"}],"about":[{"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/introduccion-a-los-entornos-de-trabajo-gnu-linux\/wp-json\/wp\/v2\/types\/page"}],"author":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/introduccion-a-los-entornos-de-trabajo-gnu-linux\/wp-json\/wp\/v2\/users\/1"}],"replies":[{"embeddable":true,"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/introduccion-a-los-entornos-de-trabajo-gnu-linux\/wp-json\/wp\/v2\/comments?post=791"}],"version-history":[{"count":9,"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/introduccion-a-los-entornos-de-trabajo-gnu-linux\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/791\/revisions"}],"predecessor-version":[{"id":1267,"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/introduccion-a-los-entornos-de-trabajo-gnu-linux\/wp-json\/wp\/v2\/pages\/791\/revisions\/1267"}],"wp:attachment":[{"href":"http:\/\/eines-informatiques.recursos.uoc.edu\/introduccion-a-los-entornos-de-trabajo-gnu-linux\/wp-json\/wp\/v2\/media?parent=791"}],"curies":[{"name":"wp","href":"https:\/\/api.w.org\/{rel}","templated":true}]}}