«Introducció als entorns de treball GNU/Linux» és un capítol que ofereix una guia detallada per treballar en sistemes operatius basats en la filosofia GNU/Linux. El llibre comença amb una introducció a la història i l’evolució de GNU/Linux, i després s’endinsa en els conceptes bàsics del sistema operatiu. Al llarg del capítol, es cobreixen temes com l’estructura d’arxius i directoris, les ordres i eines bàsiques de GNU/Linux, la gestió de processos i recursos, l’automatització de tasques i la programació de scripts en la shell.
A més, el capítol aborda temes avançats, com l’administració d’usuaris i permisos. Els estudiants aprenen a utilitzar eines com vi i sed per a l’edició d’arxius de text, i a gestionar el sistema operatiu a través de la línia d’ordres.
En finalitzar el capítol, l’estudiant pot manipular molts tipus d’informació de forma senzilla i eficient. Juntament amb aquest entorn de treball, l’estudiant ha descobert que es té accés lliure a una gran quantitat de dades biològiques que, en emmagatzemar localment en la pròpia màquina, s’accelera el processament i es redueix el temps de càlcul. En resum, aquest nucli d’eines conforma una excel·lent aproximació per extreure nou coneixement a partir de la informació biològica disponible.