Introducción

En los últimos años hemos asistido a una revolución tecnológica sin parangón. Con la aparición de las primeras computadoras, la incesante miniaturización de sus componentes y la conexión global de estas mediante una red universal, los seres humanos hemos construido una visión radicalmente novedosa del mundo que nos rodea. Actualmente resulta difícil concebir la investigación en cualquier área de conocimiento sin el concurso de la informática. La biología molecular no es una excepción. Quizás no somos conscientes de la envergadura del salto conceptual experimentado en este campo. A raíz del descubrimiento a mitad del siglo pasado de la estructura de la molécula de ADN y de la obtención de su secuencia en los inicios del siglo actual, empezamos a estar en condiciones de abordar sinceramente el problema de la constitución de la vida misma. Ahora gozamos de la inigualable ventaja de conocer, para numerosas especies, el catálogo de genes y proteínas que gobiernan la mayoría de las respuestas celulares durante su desarrollo o en respuesta a las condiciones cambiantes de nuestro entorno.

Mientras la mejora de la secuenciación masiva permite reconstruir la cartografía de los genomas, la potenciación de las telecomunicaciones ofrece un entorno ideal para poner estos datos a disposición de la comunidad científica. No obstante, toda esta fantástica amalgama de informaciones debe ser gestionada de forma eficiente. Evidentemente, la bioinformática desempeña un papel crucial en la realización rutinaria de este tipo de análisis en cualquier laboratorio de genética. Por tanto, resulta fundamental formar a nuevo personal investigador en las técnicas bioinformáticas básicas, con el objetivo de que adquieran el vocabulario específico de este campo, se agilicen sus futuras colaboraciones científicas con especialistas de dicha disciplina y comprendan el alcance de esta tecnología para integrarla dentro de sus propios proyectos de investigación.

Este módulo se centra en las aplicaciones computacionales más utilizadas por los bioinformáticos para procesar información genómica. La familia de sistemas operativos Gnu/Linux es la plataforma habitual en este tipo de laboratorios. En primer lugar, se presentarán conceptos básicos relacionados con los sistemas operativos. A continuación, se abordará el manejo del terminal de Gnu/Linux, una herramienta de trabajo fundamental para los bioinformáticos. Se aprenderán los comandos básicos y cómo combinarlos para generar comandos más potentes, creando así protocolos completos de trabajo. Por último, se explicará cómo obtener fácilmente copias de grandes conjuntos de datos biológicos de referencia para poder analizarlos localmente en nuestros ordenadores de manera sencilla. En resumen, este módulo os permitirá dominar los elementos básicos necesarios para integraros sin dificultades en cualquier entorno de investigación bioinformática.

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